BIIR-Forscher berichten die Ergebnisse der vergleichenden Untersuchung der molekularen Immunantwort auf influenza-und Pneumokokken-Impfstoffe

In einem Manuskript, veröffentlicht heute in der Abwehr, Wissenschaftler am Baylor-Institut für Immunologie-Forschung (BIIR) und am Benaroya Research Institute at Virginia Mason Bericht die Ergebnisse einer vergleichenden Untersuchung der molekularen Immunantwort auf influenza-und Pneumokokken-Impfstoffe. Darüber hinaus modernste web-Technologie wurde benutzt, um die Verbreitung von Daten, um zu beschleunigen das Tempo der wissenschaftlichen Entdeckung. Der Artikel verfügt über interaktive Figuren, die angepasst werden können und ermöglichen eine dynamische Untersuchung der primären Daten aus einem web-portal, das entwickelt wurde, als Teil dieser Studie und könnte als Modell dienen für zukünftige wissenschaftliche veröffentlichen und teilen von Daten.

Das team, das geführt wurde von Damien Chaussabel, PhD in der Benaroya und Jacques Banchereau, PhD , Virginia Pascual, MD, und Karolina Palucka, MD, PhD an BIIR, verwendete Systeme, Immunologie Konzept und high-throughput-profiling-Techniken zu analysieren, die molekularen und zellulären Reaktionen nach der Impfung. Sie fanden heraus, dass die influenza-Impfstoff führte zu gen-Aktivität induziert durch interferon, während die Pneumokokken-Impfstoff führte zu einer Erhöhung der myeloischen – und Entzündung-bedingten Genaktivität, was darauf hindeutet, dass die beiden Impfstoffe entlocken immun-Schutz über deutliche Immunantwort Wege.

„Diese Vereinigung von cutting-edge humane Immunologie und state-of-the-art-data-mining-Fähigkeiten wirklich bewegt, unsere Forschung auf die nächste Ebene durch die Optimierung der discovery-Prozess und die Identifizierung neuartiger Ansätze zur Bekämpfung von Krankheiten,“ sagte Dr. Palucka. „Durch das Verständnis der immun-Wege durch denen diese Impfstoffe arbeiten, können wir eine bessere Orientierung bei der Entwicklung von wirksamen Impfstoffen für andere Infektionskrankheiten.“

Systembiologische Ansätze, wie die in dieser Veröffentlichung vorgestellt generieren enorme Datenmengen, die mit Messungen von Zehntausenden von Parametern. Oft, viel von den Daten sieht wenig Untersuchung. Damit verlängern Sie den Wert der generierten Daten in dieser Studie, entwickelten die Autoren web-Anwendungen Erforschung der Daten durch die breitere wissenschaftliche Gemeinschaft. Der Artikel enthält links, die direkt zu zahlen in der web-portal, das ermöglicht die dynamische Untersuchung der vorgelegten Abbildungen und der zugrunde liegenden Daten. Leser interagieren können, und passen Sie die Artikel zahlen durch hinzufügen von Variablen oder einstellen der Parameter. Sie sind in der Lage, die Feinabstimmung Ihrer Sicht auf die Daten basiert auf Ihrer eigenen Forschungsinteressen und-Kompetenzen und untersuchen zusätzliche Hypothesen mit dem vollen Datenbestand.

„Unser Ziel war es, den Zugriff auf diese sehr komplexe Datensätze einfach und angenehm für die Ermittler, haben einzigartige Kenntnisse der Immunologie und Medizin, aber, die möglicherweise nicht über eine Menge von Bioinformatik oder Statistik Erfahrung“, erklärt Dr. Chaussabel. „Sie können sich Ihre Lieblings-Moleküle und der Einsicht, dass nur Sie, mit Ihrem einzigartigen wissen über diese Moleküle, erhalten konnte.“

Zusätzlich umfasst das system tools, zu verbessern und fördern den Austausch von neuen Erkenntnissen und Einsichten. Roman analysiert werden können, gesammelt, organisiert und geteilt durch das web-portal E-Mail-und social-networking-Anwendungen.

„Die Leichtigkeit, mit der die Ergebnisse geteilt werden können, stellt die enorme Menge von Daten, die von diesen Arten von Systemen in der Biologie Studium nur ein paar Klicks entfernt von tausenden von Immunologie-Experten“, sagte Gerald Nepom, MD, PhD, Direktor, Benaroya Research Institute. „Diese Publikation und web-portal-die Befreiung der Daten, die neu analysiert in neue Arten von den Wissenschaftlern überall in der Welt zu helfen, beschleunigen Entdeckungen.“

Diese Forschung wurde unterstützt durch Zuschüsse aus dem National Institute of Allergy and Infectious Diseases (eine von den National Institutes of Health), insbesondere der Menschlichen Immunologie Projekt-Konsortium (HIPC) und der Baylor Health Care System Foundation.

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